Frågor och svar om USA och PubMed

PubMed är en öppet tillgänglig medicinsk databas som upprätthålls av amerikanska NCBI (The National Center for Biotechnology Information).  

NCBI är en del av NLM (United States National Library of Medicine) vid NIH (National Institutes of Health), som är en amerikansk statlig myndighet för medicinsk forskning. NIH är i sin tur en del av Department of Health and Human Services (HHS), en avdelning i USA:s federala regering.  

PubMed innehåller ca 38 miljoner referenser. Den största delen av innehållet utgörs av databasen Medline.  Medline består av artiklar från drygt 5.200 tidskrifter som kvalitetsgranskats och godkänts av NLM. Medline innehåller artiklar från 1946 och framåt, och artiklarna indexeras med MeSH-termer.  

En annan del av PubMed utgörs av referenser från fulltextarkivet PubMed Central (PMC). PMC innehåller bland annat referenser till artiklar som publicerats av NIH-finansierade forskare. För mer information om skillnaderna mellan Medline och PubMed se till exempel denna artikel.

Universitetsbiblioteket har en arbetsgrupp som omvärldsbevakar förutsättningarna för PubMed. Universitetsbiblioteket bevakar kontinuerligt förändringar både i innehållet och tillgången till databasen PubMed.  

Universitetsbiblioteket har data motsvarande hela NIH/NLM:s medicinska databas PubMed nedladdad lokalt i form av XML-filer. Nya data hämtas kontinuerligt veckovis från NLM. Data från 1995 och framåt finns tillgängligt via KI:s bibliometrisystem och uppdateras även där veckovis. Data har i dagsläget begränsad sökbarhet utanför universitetsbiblioteket.

Universitetsbiblioteket har i samband med att data uppdateras i bibliometrisystemet två bevakningar för att identifiera förändringar i data:

• Övervakning av om data börjar raderas i ovanligt hög utsträckning. Då avbryts uppdateringen av bibliometridatabasen och förändringen kontrolleras manuellt. (Ca 200–500 publikationer tas normalt bort per vecka som en del i NLM:s kvalitetsarbete.)
• Förändringar av innehåll indexerade med MeSH-termer specifikt kopplade till DEI-området (diversity, equity, and inclusion), exempelvis Climate Change, Abortifacient Agents och Acquired Immunodeficiency Syndrome. 

I dagsläget finns inga tecken på att publikationer tas bort i större utsträckning än vad som vanligtvis sker i PubMed. Det finns inga tecken på att nuvarande innehållet i databasen har modifierats vad gäller förekomst av specifika MeSH-termer eller sökord.

Pågående förändringar som indirekt kan påverka innehållet i PubMed framöver är att NIH ser över sin finansiering av olika forskningsprojekt och sitt ekonomiska stöd till vissa specifika mediciniska tidskrifter. NIH har bland annat dragit tillbaka finansiellt stöd till forskningsprojekt inom bland annat mödravård, global hälsa och till medicinska tidskrifter inom miljö och klimat. Detta kommer att påverka den amerikanska forskningen inom de områden där omfördelning av forskningsfinansiering och finansiellt stöd uteblivit.  

Det går bra att söka vetenskapliga publikationer i PubMed. Med tanke på det rådande omvärldsläget är det bra att vara medveten om att PubMed ägs och förvaltas av amerikanska myndigheter. Den pågående politiska utvecklingen i USA kan på sikt få påverkan på PubMeds innehåll men i dagsläget har det inte skett några förändringar direkt kopplade till den nya administrationen i USA. 

Det är bra att vara medveten om vem som äger och förvaltar olika vetenskapliga databaser. På universitetsbiblioteket erbjuder vi tillgång till flera olika medicinska databaser som du kan söka vetenskapligt material i. 

Information om andra medicinska databaser som tillhandahålls av Universitetsbiblioteket.   

Det finns initiativ initierat av ZB MED, Tysklands nationella infrastruktur och forskningshub för data och information inom Life science. De har startat upp ett arbete med målsättning att säkra tillgången till medicinsk forskning genom att utveckla en öppen, pålitlig och hållbart alternativ till PubMed. De har säkrat nuvarande publikationsdata i PubMed och arbetar nu för att säkra framtida tillgång till nya forskningspublikationer inom medicinområdet. Läs mer om det pågående arbetet. 

Embase

Embase är en stor databas med referenser inom biomedicin, farmakologi och toxikologi. Den innehåller i stort sett hela MEDLINE men inte allt övrigt material som idag finns i PubMed. Enligt information som University of Exter fått från förlaget Elsevier som driver Embase jobbar de för att databasen ska hållas uppdaterad med det senaste innehållet oberoende av vad som händer på NIH. Som KI-ansluten har du tillgång till Embase. Läs mer om hur du söker i Embase.

Medline (Ovid)

Medline finns också sökbar via andra gränssnitt än PubMed, till exempel Ovid. Ovid Medline finns i flera versioner med olika innehåll. Som KI-ansluten har du tillgång till Ovid MEDLINE® (All), vilket är en version som innehåller allt material som finns i PubMed, dvs. både Medline och det övriga innehållet. Läs mer om hur du söker i Ovid Medline.  

Web of Science

Web of Science är en stor tvärvetenskaplig referens- och citeringsdatabas. Den består av tio olika index. Exakt vad som ingår beror på vilken typ av prenumeration man har på databasen. Som KI-ansluten har du tillgång till Science Citation Index Expanded, Social Sciences Citation Index, Arts & Humanities Citation Index och Emerging Sources Citation Index. Dessa index innehåller material från 1900 och framåt. Web of Science produceras av Clarivate Analytics. Web of Science är ett bra alternativ och komplement till PubMed eftersom det är en stor, bred kvalitetskontrollerad databas. Läs mer om hur du söker i Web of Science.  

Europe PMC

Innehållet i PubMed utgörs delvis av data från NIH/NLM:s fulltextarkiv PubMed Central (PMC). I Europa finns innehållet i Pubmed och PMC speglat i plattformen Europe PMC, som drivs och utvecklas av European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). Innehållet i Europe PMC bygger till stor del på partnerskapet med PMC men innehåller även preprint, microPublications, patent, NHS clinical guidelines och Agricola records. Läs mer om innehållet i Europe PMC.